Заказчик вычел неустойку из оплаты
В большинстве случаев да. Но есть нюансы. Право на такой зачет должен быть предусмотрен договором. Как правило условие звучит примерно так: при нарушении обязательств сумма начисленной неустойки вычитается из суммы, подлежащей к уплате за выполненной работы.
В тоже время, если вы считаете, что неустойка явно завышена, либо вы не согласны с ее начислением, у вас есть право обратиться с иском в суд.
Как вернуть удержанную неустойку
В соответствии со статьей 333 Гражданского кодекса Российской Федерации, если подлежащая уплате неустойка явно несоразмерна последствиям нарушения обязательства, суд вправе уменьшить неустойку.


Чтобы реализовать такое право нужно направить заказчику претензию с просьбой возвратить сумму неустойки, которую вы считаете излишне начисленной и после истечения срока ответа подать исковое заявление.
В предмет доказывания по настоящему делу входит: факт приобретения или сбережения ответчиком денежных средств за счет истца; отсутствие установленных законом, иными правовыми актами или сделкой оснований для приобретения; размер неосновательного обогащения.
Факт приобритения или сбережения денежных средств доказывается полученной вами претензией или письмом, в котором заказчик сообщает, что начислил и удержал неустойку из сумм подлежащих оплате
Вопрос доказывания размера неосновательного обогащения остается открытым. Если вы хотите снизить начисленную неустойку, то вам нужно обосновать такие требования. Например, завышенный процент. К примеру, 0.1% это ~36% годовых, а вот 0,2 это уже 72%, что в большинстве случаев является чрезмерным, так как превышает среднемесячные ставки коммерческого кредита.
Стоить иметь ввиду, что у суда есть право, а не обязанность снижать неустойку. Если ваши доводы покажутся неубедительными, в удовлетворении исковых требований вам откажут.
Если вы не согласны с самим фактом начисления неустойки или штрафа, то способы доказывания отсутствия нарушения обязательств совсем другие и чаще индивидуальны. Единого рецепта нет.
Госпошлина при обращении в суд
При обращении в суд с заявлением о взыскании неосновательного обогащения (излишне удержанной неустойки), государственная пошлина платится исходя из размера суммы, которую вы заявляете. Тут очень важный момент. Вам надо обоснованно рассчитать сумму, подлежащую возврату иначе может случится следующее.


Итого получается, что суд выигран на 10%. А это значит, что с ответчика взыщут из пошлины 23 000 руб. только 4 000 руб., к тому же он будет иметь право на компенсацию расходов на юриста в размере 90%